MNT 521
Biyo ve Nanoteknolojide Bilgisayar Modellemesi Yrd. Doç. Dr. ERSİN EMRE ÖREN
ENGLISH

Biyo ve Nanoteknolojide Bilgisayar Modellemesi

Dersin İçeriği

    Biyonanoteknoloji, nano boyutlu malzeme (organik ve inorganik) ve yapıların özelliklerinin kullanılanarak yeni aygıtlar ve araçlar geliştiren bir bilim ve mühendislik dalıdır. Biyonanoteknolojinin 21. yy’da malzeme ve üretimi, elektronik, enerji, biyoteknoloji ve tıp alanlarında çığır açacak yenilikler getirerek yeni bir endüstri devrimi yaratması beklenmektedir. MNT 521 dersi genel olarak sayısal yöntemler hakkında bilgi verip, diferansiyel denklemlerin hesaplamalı çözümleri, biyoenformatik, moleküler dinamik, homoloji modellemesi gibi güncel programlar hakkında uygulamalı bilgi vererek öğrencilerin bu çok hızlı gelişen alana uyum sağlamalarını amaçlar. Bu ders özellikle temel algoritma yazma/yorumlama teknikleri, diferansiyel denklemlerin çözüm teknikleri ile proteinlerin yapı modellemeleri konularına yoğunlaşacaktır.

    Bu derste programlama için MathCad Mühendislik Hesaplama Programı kullanılacaktır.

    Öğrencilerin derslere dizüstü bilgisayarları ile katılmaları gerekmektedir.

Ders Saatleri
  • Salı:            12:30 - 14:20 (Derslik 373)
  • Perşembe:   14:30 - 16:20 (Derslik B12)
Ders Planı
  • 1. Hafta      Temel Programlama ve Algoritma
  • 2. Hafta      Fonksiyonların Kökleri ve Matris Operasyonları
  • 3. Hafta      Matris Operasyonları ve Hesaplamalı İntegral
  • 4. Hafta      Diferansiyel Denklemler ve Hesaplamalı Çözüm Teknikleri
  • 5. Hafta      Diferansiyel Denklemlerin Hesaplamalı Çözümleri ve Uygulamaları
  • 6. Hafta      Diferansiyel Denklemlerin Hesaplamalı Çözümleri ve Uygulamaları
  • 7. Hafta      Moleküler Dinamik
  • 8. Hafta      Biyoenformatik
  • 9. Hafta      Biyoenformatik
  • 10. Hafta    Protein Moleküler Yapılarının Bulunması
  • 11. Hafta    Homoloji Modelleme + Proje/Sunu
  • 12. Hafta    Homoloji Modelleme
www TOBB ETÜ